lunes, 3 de junio de 2024

Este sencillo helecho tiene el genoma más grande conocido, y nadie sabe por qué

 Los científicos esperan que su estudio y el de otros genomas gigantes arrojen luz sobre la resiliencia de las especies.


El Helecho horquilla de Nueva Caledonia ( Tmesipteris oblanceolate ) posee el genoma más grande encontrado hasta ahora. ORIANE HIDALGO

El genoma humano está formado por 3 mil millones de pares de bases de ADN. Pero eso no es nada comparado con el helecho horquilla de Nueva Caledonia ( Tmesipteris oblanceolate ), una planta frondosa con zarcillos originaria de varias islas del Pacífico. Su genoma contiene la asombrosa cifra de 160 mil millones de pares de bases , lo que lo convierte en el genoma más grande jamás descubierto, informan hoy los investigadores en iScience . El hallazgo podría ayudar a los científicos a comprender cómo los genomas crecen tanto y cómo estos conjuntos masivos de genes afectan la adaptabilidad y supervivencia de las especies.

 Es un hallazgo interesante, pero no totalmente inesperado, señala Kenneth Birnbaum, biólogo del desarrollo del Centro de Genómica y Biología de Sistemas de la Universidad de Nueva York que no formó parte del equipo de investigación. “Los helechos son conocidos por esto. … Estos son los clásicos acumuladores de cromosomas”.

 El ADN está formado por pares de bases, dos moléculas conectadas por enlaces de hidrógeno. El genoma más pequeño descubierto hasta ahora pertenece al parásito de los mamíferos Encephalitozoon intestinalis , con unos míseros 2,25 millones de pares de bases.

  

Los genomas de las plantas tienden a ser más pesados, y los científicos saben que las plantas con genomas relativamente grandes tienden a vivir más tiempo, a reproducirse más lentamente y a ser más vulnerables al estrés ambiental. Pero no existe una relación clara entre el tamaño del genoma de un organismo y su complejidad física o fisiológica, señala Rose Marks, investigadora postdoctoral de la Universidad Estatal de Michigan que estudia la genómica de las plantas y no formó parte del equipo de investigación. "El tamaño del genoma no se correlaciona estrechamente con la complejidad anatómica o del organismo", dice. "Es algo que todavía no podemos controlar".

 Entra Jaume Pellicer, autor principal del estudio y botánico del Instituto Botánico de Barcelona. Él y sus colegas no buscaban entrar en los libros de récords. Más bien, estaban investigando qué papel desempeñaban las secuencias repetitivas de ADN en la evolución de plantas con genomas excepcionalmente grandes.

 Sabiendo que los helechos a menudo tienen tramos notablemente largos de ADN repetitivo, el equipo recurrió al helecho horquilla para su análisis. La planta no destaca en las selvas tropicales de las pocas islas del Pacífico, incluidas Nueva Zelanda y Nueva Caledonia, donde se encuentra, señala Pellicer. “No es una planta con flores, por lo que no recibe mucha atención. Supongo que la belleza está en el interior”.

 Los investigadores utilizaron citometría de flujo, una técnica basada en láser que analiza las características celulares, para contar los 160 mil millones de pares de bases del helecho. Eso es 11 mil millones más que el anterior poseedor del récord del genoma, una planta con flores japonesa llamada Paris japonica . Pero “la pregunta del millón”, afirma Pellicer, es por qué el helecho posee un genoma tan enorme.

 Hay dos formas principales en que las plantas obtienen genomas extragrandes . Una es la copia masiva del genoma dentro del núcleo, conocida como poliploidía. El otro es tener un conjunto de secuencias de ADN no codificantes repetitivas. "Solíamos llamar [a esas secuencias] ADN basura", dice Pellicer. Pero ahora los investigadores “saben que tienen la capacidad de insertarse en genes cercanos y proporcionarles nuevas funciones o silenciarlos”.

 Sin embargo, “es difícil imaginar”, dice Birnbaum, que producir grandes cantidades de ADN no codificante confiera “algún tipo de ventaja selectiva [al helecho]. Es una carga increíble producir ADN para cada célula y luego empaquetarlo y luego protegerlo”.

 Sin embargo, incluso mientras los investigadores continúan reflexionando sobre por qué el helecho horquilla tiene un genoma tan vasto, dudan de encontrar muchos organismos eucariotas con genomas que sean sustancialmente más grandes. "Tenemos una buena comprensión de los genomas de todas las familias [de organismos]", dice Pellicer, y es probable que el helecho esté cerca del límite superior. "Si no estamos en el extremo superior de la escala", dice, "estamos cerca de ello".

 

doi: 10.1126/ciencia.zy16lod

No hay comentarios:

Publicar un comentario